Зона затопления: 42% водяного зеркала водохранилища находится на территории республики Тува. Подавляющая часть его приходится на равнинную часть Тувинской котловины - двух кожуунов республики Улуг-Хемского и Чаа-Хольского. В ходе затопления под водой оказался город Шагонар (Старый Шагонар) и деревня Чаа-Холь. Кроме того, совершенно не изученные археологические памятники - древнее поселение тюрков и места их захоронений. Из-за поспешности строительства ГЭС, что было вызванно необходимостью её постройки ко дню рождения В. И. Ленина (его именем она была названа), перед затоплением не были проведены все необходимые работы по подготовке территории. Так на дне сегодняшнего водохранилища покоятся миллионы кубометров лесов, покрывавших Саянский каньон, в связи с чем судоходство каких-либо судов на водохранилище является весьма бесперспективным. Фактический отказ от исследования уникальных археологических объектов (указано выше). Населённые пункты со всеми коммуникациями и кладбища были фактически просто брошены и затоплены (взамен них были построены новые), что привело к распростронению различных инфекций по водному бассейну реки. Сотни тысяч гектаров сельхозугодий ушли под воду. На сегодняшний день акватория водохранилища на территории республики Тува по прежнему является мёртвой зоной. Обитающая здесь рыба малопригодна в пищу в виду опасности заражения, в том числе брюшным тифом. Громадная территория земель в Тувинской котловине прилегающая к водохранилищу заболочена, засолена и эпидемиологически небезопасна. В связи с этим все вновь созданные населённые пункты расположены на расстоянии 1,5-3 км от побережья (фактически зона отчуждения). На территории водохранилища (не смотря на его значительную глубину до 200 с лишним метров) отсутствует какой-либо речной транспорт. Гигантское водяное зеркало на территории республики значительно влияет на сухой микроклимат республики. Не смотря на громадные прибыли этой самой мощной в России и в бывшем СССР ГЭС (6,4 млн. кВт) выплаты связанные с затоплением территорий и нарушением экологии с момента основания предприятия не ведутся.
Параметры водохранилища:
В пределах Саянского каньона ширина 0,5—3 км, глубина 30—220 м;
В Тувинской котловине (где водохранилище имеет озеровидный характер) ширина составляет 6—9 км, глубина — от 8—10 до 30 м.
Площадь зеркала водохранилища 621 км2.
Общий объем водохранилища 31,34 км3,
Полезный объем 15,34 км3.
Годовой ход уровня воды в водохранилище за счет сработки ее через агрегаты СШГЭС достикает 40 метров.
