Чаще всего огонь приходит с сопредельных территорий, а взимание ущерба в подобных случаях не предусмотрено законодательством России.
В огне гибнут кладки многих наземных гнездящихся птиц, зайчата, лишаются укрытия грызуны (кормовая база хищников), а также поздно гнездящиеся птицы, которые вынуждены перемещаться на невыгоревшие участки, что, в конечном счете, ведет к нарушению естественного хода процессов и явлений в экосистемах.
Степь всегда была связана с присутствием копытных животных и их воздействием на степные экосистемы, то есть поддерживался определенный баланс. Учитывая это обстоятельство, заповедник поставил перед собой задачу определить оптимальные пастбищные нагрузки, при которых степные экосистемы (включая присутствие копытных) могли бы сбалансирование функционировать и не подвергались бы вторичной деградации в условиях абсолютно заповедного режима. Для решения этой задачи начато проведение эксперимента по выпасу лошадей на специально отведенных площадях и ведение мониторинга на выпасаемых и не выпасаемых территориях.
