Довольно разнообразно птичье население. Повсеместно многочисленны желтая трясогузка, полевой жаворонок (на лугах), камышевка-барсучок (в зарослях кустарников). Обычными являются садовая камышевка, чекан черноголовый, варакушка, пятнистый сверчок, индийская камышевка, бекас, дупель, чибис, травник, коростель, реже встречаются желтоголовая трясогузка, чечевица, дроздовидная камышевка, конек степной, большой кроншнеп, журавль-красавка, перепел, пастушек, погоныш. Обычны полевой и болотный луни, реже встречаются луговой и степной. В массе гнездятся все виды речных уток. На обширных болотах на участке “Подлиственки” гнездятся 2 пары серых журавлей, 3-4 пары выпи, а на пролете встречали черного журавля. Весной на пролете в массе останавливаются турухтаны (отдельные пары гнездятся) и другие кулики. Млекопитающие представлены менее разнообразно. Преобладают мышевидные грызуны, из них наиболее многочисленны узкочерепная и водяная полевки. На участке “Подлиственки” под защитой обширных кустарниковых и тростниковых зарослей обитает популяция косули, которая живет там круглый год. Зимой обычны заяц-русак и лисица.
Водоемы и их прибрежья занимают 12% территории. Кроме таких крупных озер, как Иткуль, Шира, Беле, Улуг-Коль, на территории участков имеется ряд небольших озер. Берега небольших рек и озер большей частью заболочены и заняты осоково-тростниковыми зарослями. Хорошо развита водная растительность. На крупных озерах берега в основном песчаные, песчано-щебнистые или грязевые и лишь по мелководным заливам зарастают тростником.
На озере Улуг-Коль в послегнездовой период насчитывают до 50-80 выводков огаря, пеганки – до 20-30; там гнездятся до 80-100 пар шилоклювки (50% популяции гнездящейся в Средней Сибири), журавля-красавки – до 5 пар; а также много красноголовых нырков, шилохвостей, серых уток, чирков-трескунков, широконосок, травников, малых и морских зуйков, больших кроншнепов и др.
В августе на озере формируется скопление водоплавающих и околоводных птиц общей численностью 5-8 тыс. особей. Массовыми являются огари (3-4 тыс.), красноголовые нырки (2-3 тыс.), речные утки (1-2 тыс.), пеганки (0,3-0,6 тыс.), шилоклювки (0,4-0,5 тыс.), сизые чайки (0,3-0,4 тыс.).